ここの日記にも書いたHTTP Response Splitting Attackの対策がPHPでも取られるようです。
header(“bad-header: This is bad header\r\n but having CR/LF in a haeder is allowed by the standard in some case.”);
上記のヘッダが送られた際に\r\nを自動削除可能な設定が追加されます。ただし、\r\nがヘッダ中に現れる事は標準で認められいいますが、パッチを適用したPHPの場合は拒否&警告エラー(php.ini設定のデフォルト値になる)が発生します。もちろん「不正なユーザ入力対策は万全」というサイト向けではそのままCR/LFを送ることも可能です。次のPHPリリース時には取り込まれていると思いますが、仕様が変わっているかも知れないのでChangeLogなどで確認する必要があります。
未対策のアプリがあるサーバはエラーハンドラ(必ず作ってますよね。PHPプログラマの方!)で処理するだけです。普通にエラー処理しているPHPアプリケーションならPHP本体にパッチを当てるだけで完了です。